自圖書館2018年8月接下校史業務後，於隔年5月首次舉辦校史展覽——孟德爾之夢，將成功大學博物館與捷克的孟德爾博物館合作舉辦之「豆豆與神父」展覽，移至圖書館大廳展覽，並加入陽明校區獨有的遺傳學人物武光東與陳文盛的介紹。
此後，圖書館開始每年舉辦4-6個校史展覽，包括校園建築展、老照片、陽明人物展等，也曾和《NATURE》期刊與《科學月刊》合作舉辦封面故事展，展覽時長約為半年到一年。
為保存展覽的內容，圖書館特將展覽放在網站上供大家閱覽，也歡迎大家一起透過這些展覽，更加認識學校。
| 年份 | 展覽名稱 |
| 2019 | 孟德爾之夢 |
| 2020 | 無盡的疆域：漫步神農之境 |
| 2021 | 謝謝，請在立農街口下！——綻放在唭哩岸的醫學院青春 |
| 2022 | 科技報導40年 |
| 2023 | 初心— 校史專書「篳路藍縷：從打石場到陽明醫學院」的故事 |
| 2024 | 不惑：高教與生醫政策的大學之道 |
| 2025 | 寄往開來─陽明熱帶醫學的故事 |