一、 陽明醫學院時期（1975–1994）
國立陽明醫學院創立於1975年，是戰後臺灣政府設立的第一所國立醫學院，由臺北榮民總醫院協助籌建。建校宗旨在於培育能投入偏鄉基層服務的醫學人才，首屆招收120位公費醫學生，畢業後依規定分發服務六年，以回應當時公共衛生政策下的醫療需求。
首任院長韓偉訂定「真知力行，仁心仁術」為校訓，結合實事求是的求知態度與人文關懷的醫療使命。師資多來自榮總、國防醫學院與海外歸國學者，課程設計兼顧基礎與臨床，並陸續增設牙醫、護理、醫技與學士後醫學等學系及研究所，逐步建立完整醫學教育體系。
面對北投唭哩岸原為採石場的地形與地方工業背景，建校歷經多次協調與整地，終於完成實驗大樓與「榮陽隧道」等基礎設施。1980年代後，校內推動學生自治與師生共治，成為醫學教育改革與大學轉型的重要起點。
▲陽明醫學院第一棟建築物實驗大樓於1974年6月竣工
二、 陽明大學時期（1994–2021）
順應高等教育改革浪潮，1994年陽明醫學院改制為「國立陽明大學」，成為臺灣第一所以生醫為核心的研究型大學。改制後，大學延續校訓精神，積極推動跨領域整合，從原有四個學院發展為涵蓋七大學院的完整體系。
在學術上，陽明大學於2000年與臺北榮總合作，完成「人類第四號染色體千萬鹼基定序工程」，為肝癌致病機轉研究提供關鍵線索。2005年更響應教育部「邁向頂尖大學」計畫，加強投入基因體、腦科學等前瞻領域，逐步擴展國際能見度與研究深度。
▲連結榮總與陽明的「榮陽隧道」
▲1974年隧道貫通
在有限校地與資源條件下，陽明採取「凝聚型大學」策略，積極拓展校際合作。自2000年起與交通、清華、中央大學共同組成「臺灣聯合大學系統」，共享教學與研究資源。2001年，與交通大學共同發展生醫領域而建立深厚合作基礎；2002年又與政治大學、臺北市立聯合醫院組成「聯盟醫療系統」；2008年並將衛生署宜蘭醫院改制為附設醫院，持續深化社區醫學與偏鄉服務，回應創校初衷。
2021年，陽明大學與交通大學正式合併為「國立陽明交通大學」，以嶄新姿態開啟跨域整合的新篇章。
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